Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDC20Q12834 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC20Q12834 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms