Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TROAPQ12815 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TROAPQ12815 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TROAPQ12815 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
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