Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNMA1Q12791 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNMA1Q12791 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCNMA1Q12791 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNMA1Q12791 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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