Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAPQ12770 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAPQ12770 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAPQ12770 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms