Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC38A11Q08AI6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC38A11Q08AI6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms