Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDR1Q08345 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
DDR1Q08345 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
DDR1Q08345 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms