Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTN3Q08043 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN3Q08043 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN3Q08043 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms