Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNDQ07001 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNDQ07001 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms