Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTK2Q05397 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTK2Q05397 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms