Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMX2Q04743 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMX2Q04743 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMX2Q04743 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms