Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN1Q04323 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN1Q04323 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms