Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ROM1Q03395 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms