Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMNB2Q03252 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB2Q03252 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB2Q03252 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms