Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFAIP2Q03169 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms