Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGFBR3Q03167 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGFBR3Q03167 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms