Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREMQ03060 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREMQ03060 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREMQ03060 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREMQ03060 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREMQ03060 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREMQ03060 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CREMQ03060 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREMQ03060 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREMQ03060 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREMQ03060 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREMQ03060 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREMQ03060 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREMQ03060 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREMQ03060 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREMQ03060 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREMQ03060 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREMQ03060 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREMQ03060 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREMQ03060 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CREMQ03060 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREMQ03060 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREMQ03060 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREMQ03060 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREMQ03060 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREMQ03060 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREMQ03060 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREMQ03060 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREMQ03060 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREMQ03060 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREMQ03060 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREMQ03060 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREMQ03060 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREMQ03060 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREMQ03060 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREMQ03060 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREMQ03060 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREMQ03060 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREMQ03060 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREMQ03060 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREMQ03060 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREMQ03060 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREMQ03060 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREMQ03060 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREMQ03060 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREMQ03060 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREMQ03060 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREMQ03060 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREMQ03060 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREMQ03060 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREMQ03060 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CREMQ03060 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREMQ03060 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREMQ03060 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREMQ03060 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREMQ03060 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CREMQ03060 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CREMQ03060 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREMQ03060 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CREMQ03060 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CREMQ03060 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREMQ03060 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREMQ03060 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CREMQ03060 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREMQ03060 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREMQ03060 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREMQ03060 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREMQ03060 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREMQ03060 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREMQ03060 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREMQ03060 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms