Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLH2Q02577 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLH2Q02577 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLH2Q02577 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NHLH2Q02577 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms