Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLCB3Q01970 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLCB3Q01970 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLCB3Q01970 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLCB3Q01970 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PLCB3Q01970 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLCB3Q01970 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms