Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK17Q00537 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK17Q00537 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK17Q00537 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms