Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITPNAQ00169 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNAQ00169 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms