Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKD1P98161 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKD1P98161 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKD1P98161 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKD1P98161 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKD1P98161 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PKD1P98161 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKD1P98161 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKD1P98161 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKD1P98161 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKD1P98161 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKD1P98161 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKD1P98161 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKD1P98161 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKD1P98161 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKD1P98161 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PKD1P98161 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKD1P98161 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKD1P98161 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKD1P98161 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKD1P98161 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKD1P98161 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKD1P98161 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKD1P98161 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKD1P98161 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKD1P98161 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKD1P98161 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKD1P98161 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKD1P98161 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKD1P98161 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKD1P98161 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKD1P98161 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKD1P98161 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKD1P98161 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKD1P98161 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKD1P98161 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKD1P98161 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKD1P98161 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKD1P98161 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKD1P98161 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKD1P98161 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms