Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP5P82980 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP5P82980 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP5P82980 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP5P82980 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP5P82980 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP5P82980 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBP5P82980 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP5P82980 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP5P82980 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP5P82980 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP5P82980 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP5P82980 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBP5P82980 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBP5P82980 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP5P82980 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP5P82980 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBP5P82980 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBP5P82980 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBP5P82980 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP5P82980 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP5P82980 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP5P82980 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP5P82980 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP5P82980 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBP5P82980 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP5P82980 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP5P82980 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP5P82980 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP5P82980 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP5P82980 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP5P82980 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBP5P82980 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBP5P82980 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP5P82980 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP5P82980 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP5P82980 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP5P82980 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP5P82980 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP5P82980 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP5P82980 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBP5P82980 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBP5P82980 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBP5P82980 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP5P82980 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP5P82980 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP5P82980 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBP5P82980 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBP5P82980 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBP5P82980 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RBP5P82980 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP5P82980 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBP5P82980 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms