Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX4P78413 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX4P78413 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX4P78413 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX4P78413 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX4P78413 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX4P78413 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX4P78413 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX4P78413 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX4P78413 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX4P78413 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX4P78413 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX4P78413 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX4P78413 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX4P78413 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX4P78413 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX4P78413 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX4P78413 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX4P78413 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX4P78413 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX4P78413 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX4P78413 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX4P78413 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX4P78413 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX4P78413 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX4P78413 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX4P78413 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX4P78413 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX4P78413 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX4P78413 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX4P78413 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX4P78413 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX4P78413 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX4P78413 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX4P78413 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX4P78413 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX4P78413 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX4P78413 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX4P78413 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX4P78413 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX4P78413 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX4P78413 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX4P78413 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX4P78413 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX4P78413 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX4P78413 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX4P78413 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX4P78413 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX4P78413 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX4P78413 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX4P78413 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX4P78413 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX4P78413 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX4P78413 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX4P78413 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX4P78413 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX4P78413 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms