Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PITX1P78337 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITX1P78337 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITX1P78337 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITX1P78337 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITX1P78337 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITX1P78337 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITX1P78337 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITX1P78337 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PITX1P78337 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PITX1P78337 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX1P78337 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX1P78337 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX1P78337 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX1P78337 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX1P78337 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX1P78337 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX1P78337 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PITX1P78337 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PITX1P78337 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PITX1P78337 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITX1P78337 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITX1P78337 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PITX1P78337 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX1P78337 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX1P78337 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX1P78337 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX1P78337 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX1P78337 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PITX1P78337 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX1P78337 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX1P78337 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX1P78337 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX1P78337 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX1P78337 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PITX1P78337 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITX1P78337 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PITX1P78337 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PITX1P78337 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITX1P78337 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITX1P78337 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITX1P78337 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PITX1P78337 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX1P78337 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX1P78337 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX1P78337 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX1P78337 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITX1P78337 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITX1P78337 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PITX1P78337 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PITX1P78337 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITX1P78337 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITX1P78337 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX1P78337 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX1P78337 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX1P78337 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX1P78337 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX1P78337 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX1P78337 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITX1P78337 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX1P78337 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX1P78337 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX1P78337 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX1P78337 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX1P78337 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITX1P78337 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms