Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR4P61073 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR4P61073 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR4P61073 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCR4P61073 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR4P61073 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR4P61073 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR4P61073 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR4P61073 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR4P61073 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR4P61073 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR4P61073 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCR4P61073 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCR4P61073 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR4P61073 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR4P61073 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR4P61073 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR4P61073 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCR4P61073 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR4P61073 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR4P61073 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCR4P61073 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCR4P61073 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR4P61073 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR4P61073 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR4P61073 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CXCR4P61073 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR4P61073 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CXCR4P61073 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms