Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTXN1P60606 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTXN1P60606 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTXN1P60606 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms