Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA1P56199 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGA1P56199 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms