Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH4P55283 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH4P55283 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH4P55283 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH4P55283 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH4P55283 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH4P55283 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH4P55283 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH4P55283 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH4P55283 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH4P55283 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH4P55283 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH4P55283 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH4P55283 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH4P55283 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH4P55283 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH4P55283 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH4P55283 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH4P55283 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH4P55283 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH4P55283 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH4P55283 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH4P55283 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH4P55283 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH4P55283 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH4P55283 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH4P55283 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH4P55283 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH4P55283 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH4P55283 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH4P55283 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH4P55283 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH4P55283 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH4P55283 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH4P55283 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms