Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HADHBP55084 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HADHBP55084 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HADHBP55084 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HADHBP55084 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HADHBP55084 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HADHBP55084 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HADHBP55084 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HADHBP55084 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HADHBP55084 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HADHBP55084 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HADHBP55084 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HADHBP55084 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HADHBP55084 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHBP55084 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHBP55084 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHBP55084 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHBP55084 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHBP55084 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHBP55084 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HADHBP55084 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHBP55084 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHBP55084 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHBP55084 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHBP55084 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HADHBP55084 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HADHBP55084 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHBP55084 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHBP55084 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHBP55084 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHBP55084 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHBP55084 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHBP55084 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHBP55084 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHBP55084 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHBP55084 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHBP55084 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHBP55084 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHBP55084 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHBP55084 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHBP55084 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHBP55084 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHBP55084 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHBP55084 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHBP55084 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHBP55084 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms