Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA4P54764 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA4P54764 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms