Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNB3P54284 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNB3P54284 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNB3P54284 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms