Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PMS2P54278 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P54278 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P54278 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P54278 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P54278 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P54278 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P54278 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PMS2P54278 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P54278 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P54278 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P54278 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P54278 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P54278 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P54278 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P54278 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P54278 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P54278 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P54278 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P54278 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P54278 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PMS2P54278 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P54278 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P54278 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P54278 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P54278 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P54278 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P54278 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PMS2P54278 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P54278 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P54278 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P54278 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P54278 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PMS2P54278 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P54278 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P54278 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P54278 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P54278 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P54278 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P54278 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P54278 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P54278 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P54278 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P54278 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P54278 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P54278 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P54278 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P54278 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P54278 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P54278 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMS2P54278 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P54278 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P54278 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P54278 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P54278 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P54278 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS2P54278 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS2P54278 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS2P54278 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS2P54278 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P54278 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P54278 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P54278 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P54278 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P54278 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P54278 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P54278 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P54278 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P54278 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P54278 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P54278 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P54278 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P54278 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P54278 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P54278 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P54278 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P54278 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P54278 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P54278 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P54278 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P54278 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P54278 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P54278 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P54278 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P54278 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms