Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIMK2P53671 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms