Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVDP53602 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVDP53602 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MVDP53602 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MVDP53602 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MVDP53602 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVDP53602 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVDP53602 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MVDP53602 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MVDP53602 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MVDP53602 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MVDP53602 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MVDP53602 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MVDP53602 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MVDP53602 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MVDP53602 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MVDP53602 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MVDP53602 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MVDP53602 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MVDP53602 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MVDP53602 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MVDP53602 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MVDP53602 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MVDP53602 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MVDP53602 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MVDP53602 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MVDP53602 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MVDP53602 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms