Protein–RNA interactions for Protein: P53370

NUDT6, Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 6, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT6P53370 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUDT6P53370 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUDT6P53370 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms