Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KPNA1P52294 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KPNA1P52294 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA1P52294 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms