Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLCSP50747 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLCSP50747 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLCSP50747 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLCSP50747 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLCSP50747 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLCSP50747 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLCSP50747 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLCSP50747 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLCSP50747 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLCSP50747 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLCSP50747 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLCSP50747 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLCSP50747 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLCSP50747 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLCSP50747 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HLCSP50747 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLCSP50747 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLCSP50747 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HLCSP50747 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLCSP50747 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLCSP50747 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HLCSP50747 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLCSP50747 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLCSP50747 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLCSP50747 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLCSP50747 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLCSP50747 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLCSP50747 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HLCSP50747 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLCSP50747 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLCSP50747 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLCSP50747 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLCSP50747 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HLCSP50747 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLCSP50747 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLCSP50747 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HLCSP50747 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLCSP50747 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLCSP50747 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLCSP50747 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLCSP50747 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLCSP50747 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLCSP50747 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLCSP50747 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLCSP50747 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLCSP50747 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLCSP50747 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLCSP50747 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLCSP50747 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLCSP50747 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLCSP50747 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLCSP50747 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLCSP50747 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLCSP50747 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLCSP50747 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLCSP50747 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLCSP50747 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLCSP50747 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLCSP50747 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLCSP50747 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLCSP50747 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLCSP50747 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms