Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD97P48960 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD97P48960 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD97P48960 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD97P48960 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD97P48960 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD97P48960 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD97P48960 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD97P48960 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD97P48960 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD97P48960 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD97P48960 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD97P48960 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD97P48960 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD97P48960 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD97P48960 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD97P48960 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD97P48960 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD97P48960 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD97P48960 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD97P48960 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD97P48960 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD97P48960 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD97P48960 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD97P48960 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD97P48960 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD97P48960 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD97P48960 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD97P48960 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD97P48960 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD97P48960 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD97P48960 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD97P48960 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms