Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCLMP48507 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCLMP48507 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCLMP48507 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCLMP48507 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCLMP48507 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCLMP48507 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCLMP48507 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCLMP48507 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GCLMP48507 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GCLMP48507 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCLMP48507 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCLMP48507 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCLMP48507 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCLMP48507 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCLMP48507 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCLMP48507 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCLMP48507 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCLMP48507 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCLMP48507 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCLMP48507 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCLMP48507 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCLMP48507 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCLMP48507 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCLMP48507 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GCLMP48507 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCLMP48507 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCLMP48507 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCLMP48507 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GCLMP48507 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCLMP48507 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCLMP48507 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCLMP48507 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCLMP48507 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLMP48507 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLMP48507 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLMP48507 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLMP48507 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLMP48507 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLMP48507 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCLMP48507 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLMP48507 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLMP48507 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLMP48507 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLMP48507 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCLMP48507 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms