Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARCN1P48444 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARCN1P48444 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms