Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ALDH1A3P47895 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ALDH1A3P47895 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms