Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCC3P46736 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRCC3P46736 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms