Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RECQLP46063 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RECQLP46063 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RECQLP46063 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RECQLP46063 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RECQLP46063 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RECQLP46063 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RECQLP46063 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RECQLP46063 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RECQLP46063 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RECQLP46063 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RECQLP46063 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RECQLP46063 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RECQLP46063 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RECQLP46063 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RECQLP46063 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RECQLP46063 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RECQLP46063 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RECQLP46063 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RECQLP46063 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RECQLP46063 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RECQLP46063 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RECQLP46063 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RECQLP46063 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RECQLP46063 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RECQLP46063 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RECQLP46063 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RECQLP46063 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RECQLP46063 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RECQLP46063 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RECQLP46063 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RECQLP46063 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RECQLP46063 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RECQLP46063 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RECQLP46063 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RECQLP46063 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RECQLP46063 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RECQLP46063 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RECQLP46063 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RECQLP46063 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RECQLP46063 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RECQLP46063 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RECQLP46063 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RECQLP46063 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RECQLP46063 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RECQLP46063 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RECQLP46063 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RECQLP46063 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RECQLP46063 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RECQLP46063 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RECQLP46063 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RECQLP46063 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RECQLP46063 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RECQLP46063 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RECQLP46063 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RECQLP46063 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RECQLP46063 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RECQLP46063 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RECQLP46063 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RECQLP46063 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RECQLP46063 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RECQLP46063 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RECQLP46063 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RECQLP46063 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RECQLP46063 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RECQLP46063 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RECQLP46063 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RECQLP46063 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RECQLP46063 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms