Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP5P45974 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP5P45974 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP5P45974 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP5P45974 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP5P45974 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP5P45974 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP5P45974 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP5P45974 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP5P45974 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP5P45974 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP5P45974 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP5P45974 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP5P45974 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP5P45974 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP5P45974 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP5P45974 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP5P45974 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP5P45974 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP5P45974 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP5P45974 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP5P45974 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP5P45974 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP5P45974 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP5P45974 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP5P45974 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP5P45974 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP5P45974 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP5P45974 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP5P45974 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP5P45974 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP5P45974 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP5P45974 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP5P45974 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP5P45974 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP5P45974 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP5P45974 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP5P45974 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP5P45974 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP5P45974 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP5P45974 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP5P45974 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP5P45974 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP5P45974 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP5P45974 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP5P45974 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP5P45974 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP5P45974 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP5P45974 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP5P45974 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP5P45974 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP5P45974 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP5P45974 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP5P45974 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP5P45974 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP5P45974 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP5P45974 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP5P45974 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP5P45974 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP5P45974 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP5P45974 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP5P45974 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
USP5P45974 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP5P45974 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP5P45974 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP5P45974 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP5P45974 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP5P45974 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP5P45974 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP5P45974 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP5P45974 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP5P45974 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP5P45974 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP5P45974 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP5P45974 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP5P45974 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP5P45974 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP5P45974 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP5P45974 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP5P45974 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP5P45974 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP5P45974 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP5P45974 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP5P45974 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms