Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC1A1P43005 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A1P43005 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms