Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAA2P42765 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACAA2P42765 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACAA2P42765 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAA2P42765 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAA2P42765 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.8 ms