Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE6BP35913 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE6BP35913 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE6BP35913 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms