Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPB2P35606 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPB2P35606 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPB2P35606 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPB2P35606 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPB2P35606 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPB2P35606 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB2P35606 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB2P35606 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB2P35606 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COPB2P35606 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB2P35606 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB2P35606 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB2P35606 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB2P35606 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPB2P35606 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB2P35606 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB2P35606 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB2P35606 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB2P35606 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB2P35606 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COPB2P35606 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPB2P35606 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPB2P35606 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COPB2P35606 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COPB2P35606 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB2P35606 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB2P35606 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB2P35606 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB2P35606 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB2P35606 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COPB2P35606 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPB2P35606 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COPB2P35606 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COPB2P35606 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB2P35606 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB2P35606 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB2P35606 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB2P35606 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB2P35606 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB2P35606 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COPB2P35606 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COPB2P35606 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COPB2P35606 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COPB2P35606 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPB2P35606 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms