Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 310.76□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 PCSK6-206ENST00000558864 3868 ntTSL 28.3□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 421.29■■□□□ 12e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.421e-12■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 AL162258.1-203ENST00000472233 637 ntTSL 315.81■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 AL162258.2-201ENST00000607839 552 ntTSL 311.75□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 AL162258.1-202ENST00000484413 508 ntTSL 26.94□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.351e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 315.71■□□□□ 0.111e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 418.42■□□□□ 0.541e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)16.48■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.091e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.071e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 414.04□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 TMEM14B-213ENST00000478732 344 ntTSL 513.96□□□□□ -0.171e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-203ENST00000577867 1211 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.41e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 TMEM14B-205ENST00000463100 502 ntTSL 412.28□□□□□ -0.441e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.611e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-204ENST00000578835 674 ntTSL 210□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 58.66□□□□□ -1.021e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 TMEM14B-207ENST00000467229 483 ntTSL 37.55□□□□□ -1.21e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-206ENST00000581212 721 ntTSL 1 (best)6.69□□□□□ -1.341e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-209ENST00000582862 424 ntTSL 1 (best)6.69□□□□□ -1.341e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 TMEM14B-217ENST00000489137 374 ntTSL 35.47□□□□□ -1.531e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)4.29□□□□□ -1.721e-11■■■■■ 41.9
GTF2F1P35269 MVD-207ENST00000563463 543 ntTSL 318.3■□□□□ 0.524e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.242e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.842e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.722e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.232e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-206ENST00000547780 582 ntTSL 522.91■■□□□ 1.262e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-236ENST00000552231 1545 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-241ENST00000552915 1071 ntTSL 512.66□□□□□ -0.382e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-223ENST00000550160 993 ntTSL 512.07□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-239ENST00000552483 895 ntTSL 511.89□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-205ENST00000547321 577 ntTSL 211.43□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-242ENST00000553020 576 ntTSL 511.43□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-229ENST00000551179 355 ntTSL 211.43□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-243ENST00000553078 440 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-228ENST00000551132 618 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-232ENST00000551661 571 ntTSL 410.26□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-214ENST00000548741 536 ntTSL 410.25□□□□□ -0.772e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-225ENST00000550641 964 ntTSL 59.5□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-208ENST00000548021 724 ntTSL 29.5□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-237ENST00000552319 783 ntTSL 57.93□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-217ENST00000549443 457 ntTSL 47.93□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 CNOT2-238ENST00000552422 443 ntTSL 37.17□□□□□ -1.262e-9■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 SLC25A15-204ENST00000478827 1142 ntTSL 528.54■■■□□ 2.162e-11■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 NFRKB-204ENST00000526884 568 ntTSL 326.12■■□□□ 1.772e-11■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 NFRKB-211ENST00000532225 938 ntTSL 525.27■■□□□ 1.642e-11■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 NFRKB-206ENST00000529319 843 ntTSL 325.27■■□□□ 1.642e-11■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 NFRKB-207ENST00000530278 895 ntTSL 324.23■■□□□ 1.472e-11■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.922e-11■■■■■ 41.8
GTF2F1P35269 RABEP1-207ENST00000575991 551 ntTSL 420.83■□□□□ 0.939e-11■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 RABEP1-206ENST00000575475 2768 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.89e-11■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.729e-11■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.919e-11■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.288e-10■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.769e-7■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.59e-7■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.348e-10■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.248e-10■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.28e-10■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 GALNS-207ENST00000565364 1075 ntTSL 1 (best)22.89■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 GALNS-209ENST00000567525 1953 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 GALNS-212ENST00000568613 1804 ntTSL 214.01□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 41.7
GTF2F1P35269 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.557e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.297e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.694e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 C21orf58-210ENST00000491666 1196 ntTSL 516.29■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 C21orf58-206ENST00000417060 1072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 41.6
GTF2F1P35269 SSBP2-207ENST00000507472 582 ntTSL 317.91■□□□□ 0.467e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 SSBP2-219ENST00000515395 1398 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 SSBP2-205ENST00000505980 1521 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.867e-7■■■■■ 41.5
GTF2F1P35269 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 41.5
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 361.2 ms