Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA4P35212 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA4P35212 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA4P35212 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA4P35212 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA4P35212 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA4P35212 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA4P35212 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA4P35212 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA4P35212 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA4P35212 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA4P35212 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA4P35212 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA4P35212 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA4P35212 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA4P35212 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA4P35212 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA4P35212 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA4P35212 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA4P35212 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA4P35212 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA4P35212 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA4P35212 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA4P35212 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA4P35212 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA4P35212 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA4P35212 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA4P35212 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA4P35212 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA4P35212 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA4P35212 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA4P35212 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA4P35212 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA4P35212 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA4P35212 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA4P35212 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA4P35212 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA4P35212 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA4P35212 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA4P35212 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA4P35212 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA4P35212 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA4P35212 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA4P35212 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA4P35212 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA4P35212 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA4P35212 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA4P35212 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA4P35212 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA4P35212 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA4P35212 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA4P35212 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA4P35212 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA4P35212 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA4P35212 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA4P35212 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA4P35212 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA4P35212 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJA4P35212 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA4P35212 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA4P35212 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA4P35212 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJA4P35212 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA4P35212 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA4P35212 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA4P35212 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA4P35212 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA4P35212 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA4P35212 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA4P35212 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA4P35212 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA4P35212 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA4P35212 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA4P35212 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA4P35212 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA4P35212 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA4P35212 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA4P35212 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA4P35212 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA4P35212 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms